Promoter predictions for 1 prokaryotic sequence with score cutoff 0.80 (transcription start shown in larger font):

Promoter predictions for gi|339505|gb|J02846|HUMTFPB :

Start   End    Score                Promoter Sequence
367 412 0.96 AAATGTTGTAAATGCCGCCTCTCCCACTTTATCACCAAATGGAAGGGAAG
1390 1435 0.98 CACGTGTTGGCGTGCAGAGGTTTGGATATTATCTTTCATTATATGTGCAT
1408 1453 0.93 GGTTTGGATATTATCTTTCATTATATGTGCATCTTCCCTTAATAAAGAGC
1516 1561 0.91 GGCTGGATTGCTGCTTAGATTGGAGCAGGTACAACGTTGTGCATGCCCCG
1611 1656 0.96 GCGTACTGGCAAAGCAGACCTTCATAAGAAATAATCCTGATCCAATACAG
1700 1745 0.89 TGGAAGTTTCAGTGTAGCGACATTTCAGATAAAAGTGGAAAAAGTGAAGT
1729 1774 0.92 TAAAAGTGGAAAAAGTGAAGTTTGGCTTTTTTCATTTGTATGCAGTCCTA
1907 1952 0.84 TCAAGTTATAACAAGGCTTTGCCCATGAATAATTTCAAACGAAAATGTCA
1918 1963 0.83 CAAGGCTTTGCCCATGAATAATTTCAAACGAAAATGTCAAGATCCTTGCC
1992 2037 0.99 TCTTGTCATGAAGAAATTCTAGGTCTAGAAAAAATTTGAAGATTCTTTTT
2067 2112 0.98 TTTGTGGTTGAAAAATAAAAAGTGAGGTTTATGGTGATGTCAGGTGGGAA
2105 2150 0.86 GTCAGGTGGGAAGGTGTTTTATACATCAATACATTCGAGTGCTCTGAAGT
2179 2224 0.96 GTTGTTTAAAGGCACTACAAATACTGTGGCAGCATATAATTTAACTTGGA
2216 2261 0.98 AATTTAACTTGGAAATCAACTAATTTCAAGACAATTTTGGAGTGGGAACC
2249 2294 0.94 ATTTTGGAGTGGGAACCCAAACCCGTCAATCAAGTCTACACTGTTCAAAT
2366 2411 0.97 GAATGTCTTTAAAGCTGATTACTGGATGAAATTATTTAACAGATGACGAA
2395 2440 0.87 AATTATTTAACAGATGACGAAGAAGAAGGGATTCTTGGCAATTCGCTGGC
2422 2467 0.88 GGGATTCTTGGCAATTCGCTGGCCGGTGTCATACTCTATTAGGCCTGCAA
2497 2542 0.85 ACATTTTAATTGTTTTAATTGTTTTTGGAAATGATGGGAGAGTTCCTAAG
2505 2550 0.92 ATTGTTTTAATTGTTTTTGGAAATGATGGGAGAGTTCCTAAGTGGAGTAT
2525 2570 0.92 AAATGATGGGAGAGTTCCTAAGTGGAGTATAAACTGTGGAGAGATGAACC
2632 2677 0.95 AAACATTGATGTCTTTTTCCGTTGCTGTCTAGACTGTGAACAATGTCTAA
2750 2795 0.99 ATCTTTGGACTCCATGAATCGAAATCTGGTAGAATACATGATCTTAGTGG
2898 2943 0.96 ACTCTGACTGGCAGCTGTCCCCAGGAGGCGATAATTCAGCATGTTCAATC
2950 2995 0.92 AAGGTTATGACTTCCTTGATGGTTTTCACCATATTCTTGGCAAGTTTTTG
3016 3061 0.84 AGGAGGCTTGGTAGAGATCTTATGAAATAGAGAATAGCTGCTGTGGAAAT
3032 3077 0.91 ATCTTATGAAATAGAGAATAGCTGCTGTGGAAATTATTTTAATGCTAATT
3040 3085 0.80 AAATAGAGAATAGCTGCTGTGGAAATTATTTTAATGCTAATTACATAAAA
3062 3107 0.98 AAATTATTTTAATGCTAATTACATAAAAGTACAAAAGTAGCACTAGCTAA
3136 3181 0.87 TTTTGTTTTAGCTTGTGCCAGGCCTTTTACAGCATTAGGAATGCAACTTC
3197 3242 0.98 GCATCTTTTAAGTGAATGTTCTTGTTTTTCAAAATGAACTTCATGACAGT
3320 3365 0.87 GAGAAAGATGAAGGAATTTCATAACATGAAATAATGATTACAGTTCTGGT
3370 3415 0.97 CAAACTTGTCAATTCAGATTTCACCAATTGAGAATTAGTAAGTAATTTCT
3383 3428 0.84 TCAGATTTCACCAATTGAGAATTAGTAAGTAATTTCTCTGATACAGGCCT
3447 3492 0.82 TAAACACTTTACTTCCATATGGTAAAAATTAGATTTTGGGAGGAATGCTT
3478 3523 1.00 GATTTTGGGAGGAATGCTTACCTCCTAAATATATTCAATCTAATATTTGA
3518 3563 0.98 TAATATTTGAGGACACATGGGAATATATTTATGATTCATCTGCTTTTTAA
3559 3604 0.99 GCTTTTTAAACATAAGCCTTTGTTAACTGTAAGTTCTTGAACTTTATAAG
3574 3619 0.99 GCCTTTGTTAACTGTAAGTTCTTGAACTTTATAAGGCTGCTGTTATTTAA
3814 3859 0.88 CTGGTTAAAAAGGACCAGAGCAGTCATTTTACAGTTGAGGAAACTGTTGC
4346 4391 0.97 AAATTAGTGACTGAATTTTTTAGTTAACTCAAAATTCCAAATCAGAGGGT
4441 4486 0.93 CTATTAATGGCATTCAGAGGGATTTTCTACAGAATTGTCCCTTCATTACC
4468 4513 0.90 TACAGAATTGTCCCTTCATTACCTGTTTATACAGTTTTACTACTTACCAG
4496 4541 0.92 ATACAGTTTTACTACTTACCAGGGTACTGTATAAATCCTTGTGCTAAATT
4652 4697 0.97 TATTTGCTGTACTGATAAAAAGGAAACAGCATAGTCTCATTCACTTTTTG
4685 4730 0.81 GTCTCATTCACTTTTTGAAATGGAAATGATAAAATAAAACACATTTTGGT
4697 4742 0.93 TTTTGAAATGGAAATGATAAAATAAAACACATTTTGGTCATTCGGGAACA
4879 4924 0.99 CAGATTTTGAAAGAAAATATATTTGTGGCTTTTATGTGTGAATTTAGACA
4896 4941 0.98 TATATTTGTGGCTTTTATGTGTGAATTTAGACAATGGAATCCATGTGGTG
5278 5323 0.93 AATCAAGTTGCAGTGACGCTTCACCTATTTATTATTTTGGTCATTTAGAA
5403 5448 0.97 AGCTTTTTAGTCTCAGACTTTATTAGACAGATACTACCTGTACTCTTATT
5420 5465 0.94 CTTTATTAGACAGATACTACCTGTACTCTTATTCTGTAATCTTTGTTGGG
5478 5523 0.96 ACATCTTGCAAAGGAAGGGAGGCATGTAGTATAATGGGGCAAACAGACCC
5617 5662 1.00 CCTTCTTGGAAGGATTATATCAAATGAAGTAACATGAGTAAAGGGTCCAG
5638 5683 0.94 AAATGAAGTAACATGAGTAAAGGGTCCAGCAGAATACCTGGCATATAGTG
5680 5725 0.97 ATATAGTGGAGTCAATGAATGATTAATAATATTATTAATAGTGGTCATGA
5721 5766 0.91 TGGTCATGAGAGATATATGTATAACATGTTATTATGTAGACTCACTATAT
5764 5809 0.88 ACTATATAGACTCTATTCTACATAGAATATAGAACATTATATAACAAACA
5894 5939 0.89 TGTTACCCTGACAGAGAGCGTCTACATTCTAAAAGAAAGATATTTAACAA
6022 6067 0.83 ATCTCACTTTGTCTCAGTAGCCTTATTTGTAAAAACAAGGCAAATTACAG
6123 6168 0.84 GTGTTGCTAGGTATGATGGCTCACACCTGTACATTCAGCACTTTGGGAGG
6226 6271 0.95 CAATGTTTAAAAAAAAGCAAAGTGCTCAGCACAGTGACTGCATCATTAGG
6334 6379 0.98 TTGTTGGGTGCAAATTGTAACATTCCATTTATGTTTCTTCCTTCTTTTCT

Predictions for the reverse strand of gi|339505|gb|J02846|HUMTFPB :

Start   End    Score               Promoter Sequence
6360 6315 0.94 ATAAATGGAATGTTACAATTTGCACCCAACAAGATAGACTGCTTCCTGGC
6061 6016 0.99 ATTTGCCTTGTTTTTACAAATAAGGCTACTGAGACAAAGTGAGATTGGGT
5969 5924 0.92 TATTTGACTCTTGGATCTGTACTCAACCATTTTGTTAAATATCTTTCTTT
5927 5882 0.82 CTTTCTTTTAGAATGTAGACGCTCTCTGTCAGGGTAACAGGAGAGAAAGA
5862 5817 0.87 GATGAGGCAACTGAGACAAAGTGAGGTTGTTTACTATAGTCTACTTATTA
5821 5776 0.92 TACTTATTATAGTTGTTTGTTATATAATGTTCTATATTCTATGTAGAATA
5812 5767 0.97 TAGTTGTTTGTTATATAATGTTCTATATTCTATGTAGAATAGAGTCTATA
5785 5740 0.94 TTCTATGTAGAATAGAGTCTATATAGTGAGTCTACATAATAACATGTTAT
5702 5657 0.92 TATTAATCATTCATTGACTCCACTATATGCCAGGTATTCTGCTGGACCCT
5484 5439 0.96 TTTGCAAGATGTGAATCCATCCCAACAAAGATTACAGAATAAGAGTACAG
5391 5346 0.99 AGATCTTTTTTTTGTGAGACGTCACTGAAGGGGAAATGATTTAAAGGACT
5363 5318 1.00 AGGGGAAATGATTTAAAGGACTTCTACTGACAATGAAATTCTTCTAAATG
5342 5297 0.86 TTCTACTGACAATGAAATTCTTCTAAATGACCAAAATAATAAATAGGTGA
5287 5242 0.95 CACTGCAACTTGATTCACACACTTCTGTCCCATGGAAAGTGACAGTTATG
4996 4951 0.99 ATTAGATGGTTTGCATTTACAGGTTGAATTAATACATAATCTCAGGGAAA
4926 4881 0.95 CATTGTCTAAATTCACACATAAAAGCCACAAATATATTTTCTTTCAAAAT
4859 4814 0.98 GCCAAAAGGATTTGGGTAAACACATTCTTTATCCTAAAGTGCACAAACTA
4818 4773 0.92 CACAAACTAAGATTGATACTGAAATATTTTGGTTTCTATTTATTTAATTT
4780 4735 0.90 TTTATTTAATTTTATGTGATAAAAGTAGAGAGGGTATTTTGTTCCCGAAT
4751 4706 0.90 GAGGGTATTTTGTTCCCGAATGACCAAAATGTGTTTTATTTTATCATTTC
4697 4652 0.96 TCAAAAAGTGAATGAGACTATGCTGTTTCCTTTTTATCAGTACAGCAAAT
4535 4490 0.93 AGCACAAGGATTTATACAGTACCCTGGTAAGTAGTAAAACTGTATAAACA
4472 4427 0.84 CAATTCTGTAGAAAATCCCTCTGAATGCCATTAATAGCATTAACACTTTA
4380 4335 1.00 TTGGAATTTTGAGTTAACTAAAAAATTCAGTCACTAATTTGGTTGCAGGT
4346 4301 0.86 TAATTTGGTTGCAGGTTGTTTTCCAGAAGCTTTGTAAATTCAGCTTTAGA
4334 4289 0.89 AGGTTGTTTTCCAGAAGCTTTGTAAATTCAGCTTTAGAATTCAGAACATT
4325 4280 0.88 TCCAGAAGCTTTGTAAATTCAGCTTTAGAATTCAGAACATTTCCATGGAA
4308 4263 0.86 TTCAGCTTTAGAATTCAGAACATTTCCATGGAATGAATATCACCGGTGAC
3652 3607 0.98 GCTCTGCTGTTTGCAGATCAGGAGCTGTGCTCATTTAAATAACAGCAGCC
3573 3528 1.00 AAGGCTTATGTTTAAAAAGCAGATGAATCATAAATATATTCCCATGTGTC
3508 3463 0.93 GAATATATTTAGGAGGTAAGCATTCCTCCCAAAATCTAATTTTTACCATA
3479 3434 0.84 CAAAATCTAATTTTTACCATATGGAAGTAAAGTGTTTACTAAGGTAAACT
3469 3424 0.97 TTTTTACCATATGGAAGTAAAGTGTTTACTAAGGTAAACTTCAGGCCTGT
3454 3409 0.84 AGTAAAGTGTTTACTAAGGTAAACTTCAGGCCTGTATCAGAGAAATTACT
3387 3342 0.88 TGAAATCTGAATTGACAAGTTTGACCAGAACTGTAATCATTATTTCATGT
3379 3334 0.93 GAATTGACAAGTTTGACCAGAACTGTAATCATTATTTCATGTTATGAAAT
3235 3190 0.99 ATGAAGTTCATTTTGAAAAACAAGAACATTCACTTAAAAGATGCATCGTT
3193 3148 0.84 GCATCGTTATCTAGAAGTTGCATTCCTAATGCTGTAAAAGGCCTGGCACA
3118 3073 0.99 ATACCTTTTGTTTTAGCTAGTGCTACTTTTGTACTTTTATGTAATTAGCA
3101 3056 0.95 TAGTGCTACTTTTGTACTTTTATGTAATTAGCATTAAAATAATTTCCACA
3080 3035 0.89 ATGTAATTAGCATTAAAATAATTTCCACAGCAGCTATTCTCTATTTCATA
3066 3021 0.88 AAAATAATTTCCACAGCAGCTATTCTCTATTTCATAAGATCTCTACCAAG
3014 2969 0.95 TCCTAGAACATTTCAAAAACCAAAAACTTGCCAAGAATATGGTGAAAACC
2985 2940 0.92 GCCAAGAATATGGTGAAAACCATCAAGGAAGTCATAACCTTTAGATTGAA
2814 2769 0.99 AGTCACGCATTTGGCCTCCTCCACTAAGATCATGTATTCTACCAGATTTC
2493 2448 0.81 GTTCTATCAGTTTAAGGTCTGGAAATGTTGCAGGCCTAATAGAGTATGAC
2483 2438 0.92 TTTAAGGTCTGGAAATGTTGCAGGCCTAATAGAGTATGACACCGGCCAGC
2283 2238 1.00 TGTAGACTTGATTGACGGGTTTGGGTTCCCACTCCAAAATTGTCTTGAAA
2271 2226 0.87 TGACGGGTTTGGGTTCCCACTCCAAAATTGTCTTGAAATTAGTTGATTTC
2251 2206 1.00 TCCAAAATTGTCTTGAAATTAGTTGATTTCCAAGTTAAATTATATGCTGC
2196 2151 0.91 TATTTGTAGTGCCTTTAAACAACAGAGAAACAGCTATTATTACATGCACT
2112 2067 0.86 CTTCCCACCTGACATCACCATAAACCTCACTTTTTATTTTTCAACCACAA
2082 2037 0.97 TTTTTATTTTTCAACCACAAAAGCTTCATTAGTGAATTATCAAGAGAAAA
2059 2014 0.84 CTTCATTAGTGAATTATCAAGAGAAAAAGAATCTTCAAATTTTTTCTAGA
2025 1980 0.97 TCAAATTTTTTCTAGACCTAGAATTTCTTCATGACAAGATTCACCTTGTA
1990 1945 0.81 AAGATTCACCTTGTAATCCCAGGACACCGGCAAGGATCTTGACATTTTCG
1832 1787 0.96 CCAGGAAGGGTTTTCAGTAAGTTATGGAAAAAGATAAATCCCACACGTGT
1744 1699 0.87 ACTTCACTTTTTCCACTTTTATCTGAAATGTCGCTACACTGAAACTTCCA
1519 1474 0.93 AATCCAGCCCTTTTGGATTGCCTCTACCCAAACCTAGAACAAAGATGGCC
805 760 0.88 GCTCGCAGTCTTGGGGAGCCGGTGCCCCGCGCGCTATAAAGGGCCGGCGG


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BCM HGSC